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====== Bioinformatique sous Linux ======

===== Bioinformatique générale =====
Les modules [[http://biopython.org/wiki/Main_Page|Biopython]] et [[http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page|Bioperl]] regroupent un ensemble de bibliothèques pour les langages python et perl. Ces modules proposent des outils variés tels que l'interaction avec des bases de données biologiques publiques, la manipulation, l'annotation de séquences…
===== Biologie moléculaire / Génétique =====
==== Manipulation de séquences biologiques ====
=== Alignements de séqences ===
Le paquet [[apt://blast2]] permet d'installer en local la célèbre suite d'outils développée par le [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/|NCBI]].
=== design d'oligonucléotides ===
Le logiciel **primer3** ([[apt://primer3]], [[http://frodo.wi.mit.edu/primer3/]]) permet le design d'oligonucléotides en prenant en compte de multiples critères (%GC, autocomplémentarité, taille de fragment…).
===== Biochimie =====
===== Biophysique =====

=====Voir aussi=====
   * [[http://openwetware.org/wiki/Main_Page|Openwetware]] wiki biology & biological engineering

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//Contributeur : nesthib//